Ученые из США нашли в генах современных африканцев следы неизвестного ранее вида человека. Сделать это им помогла новая методика, которая позволяет искать в современном геноме следы даже ранее неизвестных видов.
Статью с описанием работы исследователи опубликовали в научном журнале Science Advances.
Ранее уже было известно о том, что Homo sapiens скрещивались со своими близкими родственниками — неандертальцами и денисовцами (хотя некоторые считают их подвидом сапиенса или гейдельбергского человека). Два этих вида, в свою очередь, вступали в половые отношения друг с другом. Логично предположить, что представители рода Homo формировали межвидовые пары с кем-то еще. Но если ДНК человека разумного, неандертальцев и денисовцев можно извлечь из останков, то генетический материал более древних гоминидов уже сложнее получить.
Чтобы обойти эту проблему, генетики Арун Дурвасула и Шрирам Санкарараман из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе разработали методику поиска генов других видов в ДНК человека, при которой не нужно сравнивать геном того, у кого ищут «чужеродные» гены, с геномом того, от кого он эти гены получил.
Обучение алгоритма и определение времени расхождения различных вариантов ДНК (Arun Durvasula and Sriram Sankararaman / Science Advances, 2020)
Ученые обучали модель выявлять в ДНК современного человека фрагменты генома неандертальцев и денисовцев и по однонуклеотидным полиморфизмам определять вероятность, что конкретный участок ДНК был получен от какого-либо другого вида. В качестве ДНК современных людей исследователи использовали данные проекта «1000 геномов» по йоруба, менде и еще двум западноафриканским народам (всего 405 полных геномов).
У современных жителей Западной Африки обнаружили от 2 до 19 процентов ДНК, похожей на архаичную, которых не было у неандертальцев и денисовцев. Генетики протестировали несколько демографических моделей, которые могли бы объяснить их наличие, и пришли к выводу, что лучше всего наличие архаичных вариантов генов согласуется с тем, что предки йоруба, менде и двух других западноафриканских народов 43 000 лет назад скрещивались с пока неизвестными видами людей, которые отделились от общего ствола еще до появления неандертальцев и денисовцев, 625 тысяч лет назад.
Это может означать, что архаичные гоминиды существовали в Африке очень долго, до совсем недавних по эволюционным меркам времен. В целом результаты в очередной раз заставляют задуматься, как формировался облик современного Homo sapiens и, в частности, обратить внимание на то, с какими людьми скрещивались предки различных народов Африки. Об этом пока еще не слишком много известно.
Ранее ученые Принстонского университета в США впервые выявили гены неандертальцев у африканцев. Это позволяет пересмотреть историю раннего человечества. Ранее считалось, что ДНК вымерших родственников современных людей встречается только у неафриканских популяций.
